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PdbAtomInterface

Interface PdbAtomInterface

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Amélie DUVERNET aka Amelaye amelieonline@gmail.com

Table of Contents

Methods

getAltLoc()  : string
getChainId()  : string
getElement()  : string
getICode()  : string
Insertion code (column 27), empty for most residues.
getModel()  : int
The MODEL the atom belongs to, 1 when the file has none.
getName()  : string
getOccupancy()  : float
getResName()  : string
getResSeq()  : int
getSerial()  : int
getTempFactor()  : float
getX()  : float
getY()  : float
getZ()  : float
setAltLoc()  : void
setChainId()  : void
setElement()  : void
setICode()  : void
setModel()  : void
setName()  : void
setOccupancy()  : void
setResName()  : void
setResSeq()  : void
setSerial()  : void
setTempFactor()  : void
setX()  : void
setY()  : void
setZ()  : void

Methods

getICode()

Insertion code (column 27), empty for most residues.

public getICode() : string
Return values
string

getModel()

The MODEL the atom belongs to, 1 when the file has none.

public getModel() : int
Return values
int

setAltLoc()

public setAltLoc(string $altLoc) : void
Parameters
$altLoc : string

setChainId()

public setChainId(string $chainId) : void
Parameters
$chainId : string

setElement()

public setElement(string $element) : void
Parameters
$element : string

setICode()

public setICode(string $iCode) : void
Parameters
$iCode : string

setName()

public setName(string $name) : void
Parameters
$name : string

setOccupancy()

public setOccupancy(float $occupancy) : void
Parameters
$occupancy : float

setResName()

public setResName(string $resName) : void
Parameters
$resName : string

setResSeq()

public setResSeq(int $resSeq) : void
Parameters
$resSeq : int

setSerial()

public setSerial(int $serial) : void
Parameters
$serial : int

setTempFactor()

public setTempFactor(float $tempFactor) : void
Parameters
$tempFactor : float
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